甘蓝|全基因组作图揭示了与甘蓝主要农艺性状相关的新的QTL簇
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2016年7月6日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝青花菜研究团队在期刊Frontiers in Plant Science上发表了题为“Whole-Genome Mapping Reveals Novel QTL Clusters Associated with Main Agronomic Traits of Cabbage (Brassica oleracea var. capitata L.)”的研究论文。论文第一作者是吕红豪研究员和王庆彪博士,通讯作者是张扬勇研究员。

作者对甘蓝24个主要农艺性状进行了综合数量性状基因座(QTL)分析。在2011年和2012年的三个季节,利用196个品系的双单倍体群体进行了田间试验,以评估与株型、叶片和穗部性状相关的重要农艺性状。24个农艺性状共检测到144个QTL,其中4个株型相关性状25个,10个叶片相关性状64个,10个穗部相关性状55个,每个QTL可解释6.0~55.7%的表型变异。其中95个QTL贡献率大于10%,51个QTL可在一个以上季节检测到。主效QTL包括株高PH3.1(最大R2=55.7,最大LOD=28.2)、叶长L1 3.2(最大R2=31.7,最大LOD=13.95)、穗横径HTD 3.2(最大R2=28.5,最大LOD=9.49),这些QTL都可以在一个以上的季节检测到。在8条染色体上检测到12个QTL,其中最显著的4个包括Indel481-scaffold18376(3.20Mb),5个性状QTL;Indel64-scaffold35418(2.22Mb),6个QTL;scaffold39782-Indel84(1.78Mb),11个QTL;Indel353-Indel245(9.89Mb),7个QTL6个性状。此外,大多数性状聚集在同一区域内,彼此之间存在显著的相关性。对这些区域的候选基因也进行了讨论。本研究中获得的QTL及其聚类对于甘蓝育种中的标记辅助选择(MAS)和进一步了解这些性状的遗传控制是有用的。

wuyuankang
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Source: github.com/k4yt3x/flowerhd
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