甘蓝|甘蓝非特异性脂转移蛋白的全基因组鉴定及特性分析
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2018年8月10日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝青花菜研究团队在期刊peer J(2023IF=2.7)上发表了题为“Genome-wide identification and characterization of non-specific lipid transfer proteins in cabbage”的期刊论文。论文作者是季家磊博士和吕红豪研究员,通讯作者是杨丽梅研究员。

植物非特异性脂转移蛋白(non-specific lipid transfer proteins,NsLTPs)是一类能可逆结合和运输疏水分子的小分子分泌型蛋白质。NsLTPs在植物发育和抗逆性中起着重要作用。到目前为止,人们对甘蓝中的nsLTP家族知之甚少。在本研究中,通过对甘蓝基因组的综合研究,共鉴定出89个nsLTP基因。这些甘蓝nsLTP可分为6种类型(1、2、C、D、E和G)。对甘蓝nsLTPs的基因结构、理化特性、同源性、保守基序、亚细胞定位、三级结构和系统发育进行了全面的研究。空间表达分析表明,大多数已鉴定的nsLTP基因在甘蓝中呈高表达,其中许多基因表现出差异性和组织特异性表达模式。还研究了nsLTP基因在生物和非生物胁迫下的表达模式。甘蓝中大量的nsLTP基因与抗逆性有关。此外,一些nsLTP同源基因在甘蓝中的表达模式也表现出明显的差异。本研究促进了对甘蓝nsLTPs特性的认识,为进一步研究甘蓝nsLTPs的功能奠定了基础。

Figure 3 Phylogenetic tree of the predicted cabbage nsLTP genes and the representative members of
nsLTP gene family. Phylogenetic analysis was performed using FastTree based on the WAG+CAT
model. Different species are shown with different colors. The accession numbers of the nsLTPs are shown
in Table S3.

wuyuankang
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Source: github.com/k4yt3x/flowerhd
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