甘蓝|野油菜黄单胞菌1号小种菌株WHRI 3811的全基因组测定
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2019年12月,中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝青花菜研究团队在期刊Molecular Plant-Microbe Interactions(2023IF=3.5) 上发表了题为“Complete Genome Sequence of Strain WHRI 3811 Race 1 of Xanthomonas campestris pv. campestris, the Causal Agent of Black Rot of Cruciferous Vegetables”的短篇文章(RESOURCE ANNOUNCEMENT)。文章的第一作者是孔枞枞博士,通讯作者是英国University of Warwick的Joana G. Vicente和吕红豪研究员。

作者基于下一代测序(NGS)和实时单分子测序(SMRT)技术,给出了广泛应用的Xcc模式菌株WHRI 3811小种1的全基因组序列。

染色体基因组最终组装长度为5,072,566 bp,GAP为0,GC含量为65.1%。共有4661个蛋白质编码基因,6个rRNA基因,53个tRNA基因和131个ncRNA基因。已经在GenBank中登记了,登录号:CP025750

wuyuankang
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