本文最后更新于99 天前,其中的信息可能已经过时,如有错误请发送邮件到wuyk@163.com
安装依赖项:在安装 fastp
之前,你需要确保安装了以下依赖项:zlib
和 C++编译器
。大多数Linux系统已经默认安装了这些依赖项,但如果你的系统缺少其中之一,可以通过包管理器进行安装。
对于Debian/Ubuntu
sudo apt update
sudo apt install zlib1g-dev g++
依赖项安装好后,下一步就是fastp的安装包的下载,通过wget手动下载
#新建一个用于安装fastp的文件夹
mkdir fastp
#wget手动下载
wget http://opengene.org/fastp/fastp
#chmod给其权限
chmod +x fastp
#查看fastp是否安装成功
./fastp
fastp安装好后,把fastp 可执行文件的路径添加到系统的环境变量中,这样就可以在任何位置直接使用 fastp 命令
#回到主页面
cd
#打开.bashrc文件,配置系统环境变量
vim .bashrc
#将fastp的可执行文件的路径添加到系统的环境变量中,在合适的位置输入
export PATH=/home/wuyk/biosoft/fastp:$PATH
保存退出vim环境,source .bashrc刷新系统环境,就可以在任何位置使用fastp命令啦~