hisat2的官网地址：https://daehwankimlab.github.io/hisat2/download/

选择合适的版本下载hiast2的安装包，通过ftp上传至服务器

#解压压缩包
tar -zxvf hisat2-x.x.x.tar.gz
#回到主页面
cd
#打开系统环境变量文件
vim .bashrc
#将hisat2添加到系统环境变量中，在合适的位置插入以下代码
export PATH = /home/wuyk/biosoft/hisat2-2.1.0:$PATH

保存退出vim编辑，source .bashrc刷新系统环境变量，这时就可以在任何位置使用hisat2命令啦~