直接去github上下载bwa的安装包:https://github.com/lh3/bwa

或者通过以下代码直接在linux环境下载bwa安装包

#bwa软件下载
git clone https://github.com/lh3/bwa
#bwa 编译
cd bwa
make

编译完成后，输入./bwa，发现能够正常运行，说明安装完成。

输入pwd，获得bwa的安装目录，并复制

接下来，我们需要将bwa可执行文件的路径添加到系统的环境变量中，这样就可以在任何位置直接使用BWA命令

# 回到目录下
cd
# 打开系统环境变量文件
vim .bashrc
# 将bwa的可执行文件的路径添加到系统的环境变量中，在合适的位置输入
export PATH=/home/wuyk/biosoft/bwa:$PATH

保存并退出编辑后的.bashrc文件，source .bashrc刷新系统环境变量，此时即可实现在任何环境调用bwa命令啦~